Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMNB2Q03252 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMNB2Q03252 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMNB2Q03252 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMNB2Q03252 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMNB2Q03252 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNB2Q03252 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNB2Q03252 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNB2Q03252 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNB2Q03252 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNB2Q03252 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNB2Q03252 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNB2Q03252 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNB2Q03252 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNB2Q03252 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMNB2Q03252 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMNB2Q03252 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMNB2Q03252 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMNB2Q03252 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMNB2Q03252 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMNB2Q03252 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNB2Q03252 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNB2Q03252 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNB2Q03252 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNB2Q03252 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMNB2Q03252 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMNB2Q03252 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNB2Q03252 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNB2Q03252 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNB2Q03252 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMNB2Q03252 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMNB2Q03252 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMNB2Q03252 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMNB2Q03252 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMNB2Q03252 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms