Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CLTCQ00610 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CLTCQ00610 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CLTCQ00610 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CLTCQ00610 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CLTCQ00610 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CLTCQ00610 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CLTCQ00610 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CLTCQ00610 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CLTCQ00610 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CLTCQ00610 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CLTCQ00610 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CLTCQ00610 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CLTCQ00610 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CLTCQ00610 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CLTCQ00610 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
CLTCQ00610 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CLTCQ00610 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CLTCQ00610 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CLTCQ00610 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CLTCQ00610 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CLTCQ00610 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CLTCQ00610 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CLTCQ00610 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
CLTCQ00610 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CLTCQ00610 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CLTCQ00610 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CLTCQ00610 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CLTCQ00610 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CLTCQ00610 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CLTCQ00610 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CLTCQ00610 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CLTCQ00610 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CLTCQ00610 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CLTCQ00610 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
CLTCQ00610 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CLTCQ00610 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CLTCQ00610 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CLTCQ00610 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CLTCQ00610 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CLTCQ00610 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CLTCQ00610 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CLTCQ00610 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CLTCQ00610 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CLTCQ00610 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CLTCQ00610 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CLTCQ00610 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CLTCQ00610 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CLTCQ00610 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CLTCQ00610 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CLTCQ00610 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CLTCQ00610 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
CLTCQ00610 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
CLTCQ00610 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CLTCQ00610 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CLTCQ00610 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CLTCQ00610 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CLTCQ00610 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CLTCQ00610 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CLTCQ00610 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CLTCQ00610 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CLTCQ00610 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CLTCQ00610 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CLTCQ00610 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CLTCQ00610 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms