Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMAD3P84022 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMAD3P84022 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMAD3P84022 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMAD3P84022 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SMAD3P84022 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMAD3P84022 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMAD3P84022 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMAD3P84022 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMAD3P84022 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMAD3P84022 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMAD3P84022 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMAD3P84022 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMAD3P84022 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMAD3P84022 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMAD3P84022 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMAD3P84022 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMAD3P84022 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMAD3P84022 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMAD3P84022 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMAD3P84022 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMAD3P84022 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMAD3P84022 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMAD3P84022 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMAD3P84022 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMAD3P84022 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMAD3P84022 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMAD3P84022 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMAD3P84022 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMAD3P84022 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SMAD3P84022 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMAD3P84022 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SMAD3P84022 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMAD3P84022 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMAD3P84022 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SMAD3P84022 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMAD3P84022 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMAD3P84022 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMAD3P84022 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMAD3P84022 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMAD3P84022 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMAD3P84022 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMAD3P84022 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMAD3P84022 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMAD3P84022 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMAD3P84022 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMAD3P84022 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SMAD3P84022 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMAD3P84022 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMAD3P84022 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SMAD3P84022 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMAD3P84022 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMAD3P84022 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMAD3P84022 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMAD3P84022 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMAD3P84022 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMAD3P84022 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMAD3P84022 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMAD3P84022 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMAD3P84022 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMAD3P84022 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMAD3P84022 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMAD3P84022 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMAD3P84022 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMAD3P84022 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMAD3P84022 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMAD3P84022 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms