Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRX5P78411 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRX5P78411 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX5P78411 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX5P78411 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX5P78411 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX5P78411 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX5P78411 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX5P78411 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRX5P78411 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IRX5P78411 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IRX5P78411 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX5P78411 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX5P78411 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX5P78411 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX5P78411 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX5P78411 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX5P78411 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRX5P78411 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRX5P78411 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRX5P78411 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRX5P78411 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRX5P78411 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRX5P78411 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
IRX5P78411 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRX5P78411 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX5P78411 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX5P78411 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX5P78411 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX5P78411 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX5P78411 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX5P78411 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX5P78411 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX5P78411 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX5P78411 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRX5P78411 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRX5P78411 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRX5P78411 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IRX5P78411 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IRX5P78411 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX5P78411 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX5P78411 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX5P78411 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX5P78411 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX5P78411 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX5P78411 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX5P78411 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX5P78411 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX5P78411 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX5P78411 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX5P78411 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX5P78411 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX5P78411 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX5P78411 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX5P78411 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IRX5P78411 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IRX5P78411 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX5P78411 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IRX5P78411 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IRX5P78411 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IRX5P78411 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IRX5P78411 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IRX5P78411 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IRX5P78411 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IRX5P78411 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IRX5P78411 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IRX5P78411 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
IRX5P78411 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
IRX5P78411 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IRX5P78411 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IRX5P78411 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
IRX5P78411 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IRX5P78411 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IRX5P78411 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IRX5P78411 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IRX5P78411 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IRX5P78411 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IRX5P78411 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IRX5P78411 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IRX5P78411 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
IRX5P78411 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IRX5P78411 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IRX5P78411 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IRX5P78411 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IRX5P78411 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IRX5P78411 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IRX5P78411 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IRX5P78411 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IRX5P78411 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX5P78411 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRX5P78411 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms