Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNRPFP62306 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNRPFP62306 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNRPFP62306 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SNRPFP62306 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNRPFP62306 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNRPFP62306 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNRPFP62306 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNRPFP62306 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNRPFP62306 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNRPFP62306 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNRPFP62306 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNRPFP62306 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNRPFP62306 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNRPFP62306 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNRPFP62306 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNRPFP62306 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNRPFP62306 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNRPFP62306 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNRPFP62306 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNRPFP62306 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNRPFP62306 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNRPFP62306 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNRPFP62306 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNRPFP62306 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNRPFP62306 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms