Protein–RNA interactions for Protein: P62079

TSPAN5, Tetraspanin-5, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN5P62079 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN5P62079 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN5P62079 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN5P62079 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN5P62079 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN5P62079 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN5P62079 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN5P62079 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN5P62079 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN5P62079 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN5P62079 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN5P62079 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms