Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB25P57735 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB25P57735 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB25P57735 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB25P57735 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB25P57735 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB25P57735 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB25P57735 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB25P57735 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB25P57735 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB25P57735 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB25P57735 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB25P57735 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB25P57735 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB25P57735 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB25P57735 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB25P57735 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB25P57735 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB25P57735 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB25P57735 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB25P57735 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB25P57735 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB25P57735 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB25P57735 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB25P57735 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB25P57735 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB25P57735 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB25P57735 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB25P57735 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB25P57735 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB25P57735 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB25P57735 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB25P57735 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB25P57735 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB25P57735 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB25P57735 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB25P57735 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB25P57735 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB25P57735 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB25P57735 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB25P57735 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB25P57735 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB25P57735 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB25P57735 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB25P57735 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB25P57735 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB25P57735 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB25P57735 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB25P57735 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB25P57735 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB25P57735 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB25P57735 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB25P57735 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB25P57735 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB25P57735 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB25P57735 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB25P57735 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB25P57735 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB25P57735 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB25P57735 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB25P57735 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB25P57735 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB25P57735 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB25P57735 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB25P57735 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB25P57735 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB25P57735 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB25P57735 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB25P57735 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB25P57735 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB25P57735 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB25P57735 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB25P57735 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB25P57735 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB25P57735 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB25P57735 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB25P57735 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB25P57735 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB25P57735 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB25P57735 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB25P57735 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB25P57735 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB25P57735 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB25P57735 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB25P57735 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB25P57735 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB25P57735 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB25P57735 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB25P57735 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB25P57735 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB25P57735 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB25P57735 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB25P57735 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB25P57735 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB25P57735 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB25P57735 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB25P57735 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB25P57735 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB25P57735 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB25P57735 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms