Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RAB25P57735 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAB25P57735 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB25P57735 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB25P57735 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB25P57735 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB25P57735 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB25P57735 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB25P57735 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB25P57735 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB25P57735 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB25P57735 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB25P57735 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB25P57735 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB25P57735 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB25P57735 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB25P57735 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB25P57735 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB25P57735 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB25P57735 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB25P57735 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB25P57735 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB25P57735 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB25P57735 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB25P57735 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB25P57735 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB25P57735 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB25P57735 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB25P57735 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB25P57735 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB25P57735 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB25P57735 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB25P57735 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB25P57735 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB25P57735 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB25P57735 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB25P57735 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB25P57735 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB25P57735 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB25P57735 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB25P57735 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB25P57735 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB25P57735 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB25P57735 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB25P57735 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB25P57735 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB25P57735 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB25P57735 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB25P57735 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB25P57735 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB25P57735 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB25P57735 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB25P57735 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB25P57735 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB25P57735 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB25P57735 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB25P57735 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB25P57735 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB25P57735 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB25P57735 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB25P57735 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB25P57735 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB25P57735 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB25P57735 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB25P57735 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB25P57735 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB25P57735 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB25P57735 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB25P57735 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB25P57735 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB25P57735 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB25P57735 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB25P57735 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB25P57735 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB25P57735 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB25P57735 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB25P57735 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB25P57735 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB25P57735 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB25P57735 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB25P57735 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB25P57735 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB25P57735 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB25P57735 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB25P57735 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB25P57735 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB25P57735 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB25P57735 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB25P57735 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB25P57735 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB25P57735 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB25P57735 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB25P57735 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB25P57735 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB25P57735 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB25P57735 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB25P57735 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB25P57735 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB25P57735 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB25P57735 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms