Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB38P57729 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB38P57729 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB38P57729 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB38P57729 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB38P57729 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB38P57729 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB38P57729 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB38P57729 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB38P57729 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB38P57729 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB38P57729 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB38P57729 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB38P57729 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB38P57729 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB38P57729 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB38P57729 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB38P57729 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB38P57729 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB38P57729 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB38P57729 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB38P57729 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB38P57729 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB38P57729 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB38P57729 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB38P57729 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB38P57729 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB38P57729 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB38P57729 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB38P57729 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB38P57729 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB38P57729 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB38P57729 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB38P57729 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB38P57729 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB38P57729 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB38P57729 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB38P57729 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB38P57729 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB38P57729 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB38P57729 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB38P57729 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB38P57729 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB38P57729 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB38P57729 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB38P57729 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB38P57729 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB38P57729 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB38P57729 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB38P57729 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB38P57729 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB38P57729 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB38P57729 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB38P57729 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB38P57729 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB38P57729 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB38P57729 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB38P57729 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB38P57729 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB38P57729 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB38P57729 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB38P57729 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB38P57729 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB38P57729 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB38P57729 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB38P57729 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB38P57729 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB38P57729 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB38P57729 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB38P57729 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB38P57729 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB38P57729 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB38P57729 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB38P57729 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB38P57729 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB38P57729 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB38P57729 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB38P57729 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB38P57729 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB38P57729 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB38P57729 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB38P57729 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB38P57729 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB38P57729 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB38P57729 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB38P57729 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB38P57729 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB38P57729 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB38P57729 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB38P57729 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB38P57729 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB38P57729 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB38P57729 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB38P57729 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB38P57729 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB38P57729 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB38P57729 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB38P57729 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB38P57729 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB38P57729 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms