Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VCPP55072 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VCPP55072 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VCPP55072 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VCPP55072 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VCPP55072 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VCPP55072 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VCPP55072 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VCPP55072 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VCPP55072 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VCPP55072 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VCPP55072 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VCPP55072 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VCPP55072 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
VCPP55072 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VCPP55072 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VCPP55072 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VCPP55072 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VCPP55072 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VCPP55072 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VCPP55072 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VCPP55072 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VCPP55072 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VCPP55072 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VCPP55072 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VCPP55072 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VCPP55072 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VCPP55072 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VCPP55072 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCPP55072 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCPP55072 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCPP55072 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VCPP55072 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VCPP55072 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VCPP55072 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VCPP55072 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VCPP55072 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VCPP55072 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VCPP55072 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VCPP55072 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VCPP55072 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VCPP55072 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VCPP55072 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VCPP55072 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VCPP55072 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VCPP55072 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCPP55072 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCPP55072 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCPP55072 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCPP55072 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VCPP55072 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VCPP55072 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VCPP55072 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VCPP55072 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VCPP55072 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VCPP55072 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VCPP55072 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VCPP55072 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VCPP55072 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VCPP55072 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VCPP55072 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VCPP55072 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VCPP55072 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VCPP55072 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VCPP55072 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VCPP55072 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VCPP55072 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VCPP55072 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VCPP55072 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VCPP55072 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VCPP55072 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VCPP55072 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VCPP55072 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VCPP55072 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VCPP55072 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VCPP55072 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VCPP55072 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VCPP55072 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VCPP55072 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VCPP55072 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VCPP55072 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VCPP55072 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VCPP55072 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VCPP55072 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VCPP55072 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VCPP55072 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VCPP55072 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VCPP55072 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VCPP55072 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VCPP55072 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VCPP55072 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VCPP55072 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VCPP55072 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VCPP55072 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VCPP55072 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VCPP55072 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCPP55072 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCPP55072 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCPP55072 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCPP55072 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms