Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA3P51812 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA3P51812 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA3P51812 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA3P51812 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA3P51812 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA3P51812 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KA3P51812 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPS6KA3P51812 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KA3P51812 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KA3P51812 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KA3P51812 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KA3P51812 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KA3P51812 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KA3P51812 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KA3P51812 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KA3P51812 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KA3P51812 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA3P51812 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA3P51812 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA3P51812 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA3P51812 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA3P51812 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA3P51812 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS6KA3P51812 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KA3P51812 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA3P51812 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA3P51812 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA3P51812 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KA3P51812 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA3P51812 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA3P51812 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA3P51812 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA3P51812 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA3P51812 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KA3P51812 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KA3P51812 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KA3P51812 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KA3P51812 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms