Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CLCN6P51797 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLCN6P51797 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN6P51797 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLCN6P51797 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLCN6P51797 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLCN6P51797 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLCN6P51797 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLCN6P51797 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN6P51797 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN6P51797 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN6P51797 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLCN6P51797 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CLCN6P51797 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLCN6P51797 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLCN6P51797 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLCN6P51797 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLCN6P51797 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLCN6P51797 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLCN6P51797 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLCN6P51797 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLCN6P51797 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLCN6P51797 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLCN6P51797 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLCN6P51797 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLCN6P51797 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLCN6P51797 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CLCN6P51797 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLCN6P51797 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLCN6P51797 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLCN6P51797 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLCN6P51797 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLCN6P51797 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN6P51797 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN6P51797 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN6P51797 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN6P51797 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN6P51797 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLCN6P51797 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLCN6P51797 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLCN6P51797 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLCN6P51797 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLCN6P51797 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLCN6P51797 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLCN6P51797 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLCN6P51797 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLCN6P51797 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLCN6P51797 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CLCN6P51797 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLCN6P51797 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLCN6P51797 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLCN6P51797 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLCN6P51797 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLCN6P51797 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLCN6P51797 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLCN6P51797 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCN6P51797 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCN6P51797 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCN6P51797 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCN6P51797 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCN6P51797 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms