Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP11P51784 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP11P51784 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP11P51784 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP11P51784 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP11P51784 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP11P51784 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP11P51784 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP11P51784 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP11P51784 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP11P51784 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP11P51784 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP11P51784 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP11P51784 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP11P51784 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP11P51784 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP11P51784 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP11P51784 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
USP11P51784 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP11P51784 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP11P51784 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP11P51784 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP11P51784 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP11P51784 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
USP11P51784 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP11P51784 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP11P51784 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP11P51784 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP11P51784 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP11P51784 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP11P51784 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP11P51784 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP11P51784 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP11P51784 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP11P51784 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP11P51784 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP11P51784 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP11P51784 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP11P51784 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP11P51784 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP11P51784 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP11P51784 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP11P51784 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP11P51784 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP11P51784 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP11P51784 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP11P51784 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP11P51784 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP11P51784 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP11P51784 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP11P51784 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP11P51784 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP11P51784 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP11P51784 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP11P51784 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP11P51784 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP11P51784 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP11P51784 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP11P51784 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP11P51784 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
USP11P51784 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
USP11P51784 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP11P51784 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP11P51784 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP11P51784 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP11P51784 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
USP11P51784 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
USP11P51784 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP11P51784 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP11P51784 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP11P51784 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP11P51784 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP11P51784 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP11P51784 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP11P51784 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP11P51784 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP11P51784 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP11P51784 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP11P51784 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP11P51784 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP11P51784 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USP11P51784 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP11P51784 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP11P51784 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP11P51784 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP11P51784 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP11P51784 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP11P51784 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
USP11P51784 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
USP11P51784 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
USP11P51784 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP11P51784 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP11P51784 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP11P51784 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP11P51784 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP11P51784 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP11P51784 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP11P51784 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP11P51784 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP11P51784 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms