Protein–RNA interactions for Protein: P47985

UQCRFS1, Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1P47985 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UQCRFS1P47985 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UQCRFS1P47985 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UQCRFS1P47985 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UQCRFS1P47985 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UQCRFS1P47985 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UQCRFS1P47985 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UQCRFS1P47985 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UQCRFS1P47985 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UQCRFS1P47985 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UQCRFS1P47985 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UQCRFS1P47985 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UQCRFS1P47985 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UQCRFS1P47985 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UQCRFS1P47985 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UQCRFS1P47985 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UQCRFS1P47985 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UQCRFS1P47985 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UQCRFS1P47985 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UQCRFS1P47985 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UQCRFS1P47985 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UQCRFS1P47985 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UQCRFS1P47985 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UQCRFS1P47985 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UQCRFS1P47985 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UQCRFS1P47985 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UQCRFS1P47985 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UQCRFS1P47985 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UQCRFS1P47985 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UQCRFS1P47985 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UQCRFS1P47985 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UQCRFS1P47985 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UQCRFS1P47985 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UQCRFS1P47985 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UQCRFS1P47985 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCRFS1P47985 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCRFS1P47985 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms