Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBX2P40425 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBX2P40425 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBX2P40425 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBX2P40425 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBX2P40425 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBX2P40425 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBX2P40425 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBX2P40425 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBX2P40425 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PBX2P40425 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PBX2P40425 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PBX2P40425 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PBX2P40425 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PBX2P40425 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PBX2P40425 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PBX2P40425 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PBX2P40425 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PBX2P40425 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PBX2P40425 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PBX2P40425 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PBX2P40425 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PBX2P40425 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PBX2P40425 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PBX2P40425 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PBX2P40425 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PBX2P40425 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PBX2P40425 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PBX2P40425 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PBX2P40425 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PBX2P40425 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PBX2P40425 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PBX2P40425 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PBX2P40425 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PBX2P40425 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PBX2P40425 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PBX2P40425 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PBX2P40425 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PBX2P40425 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PBX2P40425 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PBX2P40425 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PBX2P40425 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PBX2P40425 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBX2P40425 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBX2P40425 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PBX2P40425 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PBX2P40425 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBX2P40425 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PBX2P40425 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBX2P40425 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PBX2P40425 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PBX2P40425 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PBX2P40425 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PBX2P40425 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PBX2P40425 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PBX2P40425 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PBX2P40425 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PBX2P40425 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PBX2P40425 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PBX2P40425 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PBX2P40425 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PBX2P40425 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PBX2P40425 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PBX2P40425 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PBX2P40425 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PBX2P40425 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PBX2P40425 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PBX2P40425 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PBX2P40425 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PBX2P40425 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PBX2P40425 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PBX2P40425 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBX2P40425 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PBX2P40425 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBX2P40425 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PBX2P40425 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBX2P40425 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBX2P40425 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBX2P40425 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBX2P40425 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBX2P40425 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBX2P40425 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBX2P40425 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBX2P40425 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBX2P40425 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBX2P40425 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBX2P40425 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBX2P40425 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBX2P40425 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBX2P40425 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBX2P40425 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBX2P40425 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PBX2P40425 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PBX2P40425 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PBX2P40425 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PBX2P40425 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PBX2P40425 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PBX2P40425 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PBX2P40425 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PBX2P40425 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms