Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINF1P36955 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINF1P36955 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINF1P36955 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINF1P36955 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINF1P36955 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINF1P36955 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINF1P36955 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINF1P36955 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINF1P36955 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINF1P36955 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINF1P36955 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINF1P36955 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINF1P36955 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINF1P36955 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms