Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDC2P34741 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDC2P34741 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDC2P34741 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDC2P34741 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDC2P34741 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDC2P34741 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDC2P34741 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDC2P34741 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDC2P34741 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDC2P34741 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDC2P34741 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDC2P34741 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDC2P34741 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDC2P34741 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDC2P34741 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDC2P34741 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDC2P34741 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDC2P34741 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDC2P34741 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDC2P34741 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDC2P34741 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDC2P34741 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDC2P34741 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDC2P34741 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDC2P34741 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDC2P34741 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SDC2P34741 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDC2P34741 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDC2P34741 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDC2P34741 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDC2P34741 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SDC2P34741 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDC2P34741 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDC2P34741 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDC2P34741 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDC2P34741 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDC2P34741 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDC2P34741 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDC2P34741 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDC2P34741 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDC2P34741 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDC2P34741 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDC2P34741 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDC2P34741 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDC2P34741 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDC2P34741 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDC2P34741 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDC2P34741 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDC2P34741 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDC2P34741 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDC2P34741 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDC2P34741 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDC2P34741 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDC2P34741 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDC2P34741 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDC2P34741 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDC2P34741 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDC2P34741 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDC2P34741 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDC2P34741 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDC2P34741 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDC2P34741 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDC2P34741 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDC2P34741 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDC2P34741 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDC2P34741 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDC2P34741 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDC2P34741 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDC2P34741 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDC2P34741 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDC2P34741 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDC2P34741 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDC2P34741 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDC2P34741 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDC2P34741 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDC2P34741 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDC2P34741 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDC2P34741 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SDC2P34741 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDC2P34741 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDC2P34741 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDC2P34741 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDC2P34741 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDC2P34741 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDC2P34741 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDC2P34741 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDC2P34741 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDC2P34741 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDC2P34741 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDC2P34741 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDC2P34741 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDC2P34741 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDC2P34741 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDC2P34741 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDC2P34741 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDC2P34741 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SDC2P34741 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDC2P34741 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDC2P34741 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms