Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MCM5P33992 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MCM5P33992 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MCM5P33992 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MCM5P33992 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MCM5P33992 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MCM5P33992 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MCM5P33992 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MCM5P33992 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MCM5P33992 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
MCM5P33992 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MCM5P33992 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
MCM5P33992 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
MCM5P33992 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
MCM5P33992 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
MCM5P33992 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MCM5P33992 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
MCM5P33992 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
MCM5P33992 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
MCM5P33992 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
MCM5P33992 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
MCM5P33992 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MCM5P33992 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
MCM5P33992 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
MCM5P33992 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
MCM5P33992 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
MCM5P33992 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
MCM5P33992 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
MCM5P33992 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MCM5P33992 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MCM5P33992 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MCM5P33992 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MCM5P33992 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
MCM5P33992 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MCM5P33992 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MCM5P33992 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MCM5P33992 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MCM5P33992 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MCM5P33992 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MCM5P33992 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MCM5P33992 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MCM5P33992 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MCM5P33992 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MCM5P33992 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MCM5P33992 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MCM5P33992 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MCM5P33992 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MCM5P33992 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MCM5P33992 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MCM5P33992 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MCM5P33992 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MCM5P33992 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MCM5P33992 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MCM5P33992 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MCM5P33992 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MCM5P33992 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MCM5P33992 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MCM5P33992 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MCM5P33992 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MCM5P33992 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MCM5P33992 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MCM5P33992 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MCM5P33992 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MCM5P33992 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MCM5P33992 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
MCM5P33992 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MCM5P33992 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
MCM5P33992 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MCM5P33992 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MCM5P33992 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MCM5P33992 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MCM5P33992 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
MCM5P33992 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MCM5P33992 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MCM5P33992 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MCM5P33992 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MCM5P33992 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MCM5P33992 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MCM5P33992 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MCM5P33992 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MCM5P33992 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MCM5P33992 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MCM5P33992 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
MCM5P33992 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MCM5P33992 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
MCM5P33992 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MCM5P33992 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
MCM5P33992 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MCM5P33992 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MCM5P33992 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
MCM5P33992 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MCM5P33992 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MCM5P33992 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MCM5P33992 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MCM5P33992 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MCM5P33992 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MCM5P33992 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MCM5P33992 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MCM5P33992 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MCM5P33992 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms