Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CPS1P31327 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CPS1P31327 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CPS1P31327 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CPS1P31327 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CPS1P31327 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CPS1P31327 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CPS1P31327 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CPS1P31327 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CPS1P31327 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CPS1P31327 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CPS1P31327 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CPS1P31327 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CPS1P31327 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
CPS1P31327 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CPS1P31327 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CPS1P31327 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
CPS1P31327 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CPS1P31327 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
CPS1P31327 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CPS1P31327 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CPS1P31327 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CPS1P31327 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CPS1P31327 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CPS1P31327 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CPS1P31327 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
CPS1P31327 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CPS1P31327 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CPS1P31327 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CPS1P31327 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
CPS1P31327 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CPS1P31327 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CPS1P31327 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CPS1P31327 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CPS1P31327 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CPS1P31327 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CPS1P31327 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
CPS1P31327 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CPS1P31327 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CPS1P31327 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CPS1P31327 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CPS1P31327 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CPS1P31327 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CPS1P31327 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CPS1P31327 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CPS1P31327 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CPS1P31327 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CPS1P31327 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CPS1P31327 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CPS1P31327 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CPS1P31327 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CPS1P31327 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CPS1P31327 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CPS1P31327 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CPS1P31327 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CPS1P31327 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CPS1P31327 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CPS1P31327 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CPS1P31327 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CPS1P31327 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CPS1P31327 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CPS1P31327 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
CPS1P31327 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CPS1P31327 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CPS1P31327 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CPS1P31327 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CPS1P31327 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CPS1P31327 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CPS1P31327 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CPS1P31327 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CPS1P31327 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CPS1P31327 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CPS1P31327 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CPS1P31327 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CPS1P31327 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CPS1P31327 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CPS1P31327 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CPS1P31327 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CPS1P31327 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CPS1P31327 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CPS1P31327 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CPS1P31327 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CPS1P31327 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CPS1P31327 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CPS1P31327 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CPS1P31327 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CPS1P31327 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CPS1P31327 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CPS1P31327 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CPS1P31327 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CPS1P31327 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CPS1P31327 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CPS1P31327 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
CPS1P31327 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CPS1P31327 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CPS1P31327 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CPS1P31327 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CPS1P31327 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CPS1P31327 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CPS1P31327 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms