Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRBP23467 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRBP23467 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRBP23467 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRBP23467 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRBP23467 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRBP23467 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRBP23467 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRBP23467 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRBP23467 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRBP23467 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRBP23467 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRBP23467 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRBP23467 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRBP23467 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRBP23467 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRBP23467 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRBP23467 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRBP23467 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRBP23467 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRBP23467 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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