Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
KCNA6P17658 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KCNA6P17658 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KCNA6P17658 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
KCNA6P17658 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
KCNA6P17658 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KCNA6P17658 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KCNA6P17658 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
KCNA6P17658 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KCNA6P17658 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
KCNA6P17658 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KCNA6P17658 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KCNA6P17658 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KCNA6P17658 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
KCNA6P17658 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KCNA6P17658 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KCNA6P17658 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KCNA6P17658 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KCNA6P17658 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
KCNA6P17658 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
KCNA6P17658 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
KCNA6P17658 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
KCNA6P17658 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
KCNA6P17658 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
KCNA6P17658 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
KCNA6P17658 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KCNA6P17658 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
KCNA6P17658 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KCNA6P17658 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
KCNA6P17658 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KCNA6P17658 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KCNA6P17658 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
KCNA6P17658 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
KCNA6P17658 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
KCNA6P17658 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
KCNA6P17658 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
KCNA6P17658 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
KCNA6P17658 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
KCNA6P17658 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
KCNA6P17658 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
KCNA6P17658 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
KCNA6P17658 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
KCNA6P17658 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
KCNA6P17658 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
KCNA6P17658 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
KCNA6P17658 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
KCNA6P17658 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
KCNA6P17658 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
KCNA6P17658 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
KCNA6P17658 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KCNA6P17658 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KCNA6P17658 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KCNA6P17658 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KCNA6P17658 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
KCNA6P17658 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KCNA6P17658 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KCNA6P17658 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KCNA6P17658 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
KCNA6P17658 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
KCNA6P17658 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
KCNA6P17658 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
KCNA6P17658 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
KCNA6P17658 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
KCNA6P17658 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
KCNA6P17658 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
KCNA6P17658 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KCNA6P17658 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KCNA6P17658 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KCNA6P17658 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
KCNA6P17658 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
KCNA6P17658 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms