Protein–RNA interactions for Protein: P08779

KRT16, Keratin, type I cytoskeletal 16, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT16P08779 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT16P08779 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT16P08779 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT16P08779 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT16P08779 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT16P08779 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT16P08779 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT16P08779 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT16P08779 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT16P08779 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT16P08779 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT16P08779 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT16P08779 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT16P08779 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT16P08779 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT16P08779 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT16P08779 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT16P08779 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT16P08779 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT16P08779 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT16P08779 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT16P08779 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT16P08779 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT16P08779 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT16P08779 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT16P08779 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT16P08779 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT16P08779 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT16P08779 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT16P08779 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT16P08779 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT16P08779 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT16P08779 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT16P08779 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT16P08779 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT16P08779 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT16P08779 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT16P08779 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT16P08779 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT16P08779 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT16P08779 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT16P08779 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT16P08779 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT16P08779 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT16P08779 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT16P08779 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT16P08779 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT16P08779 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT16P08779 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT16P08779 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT16P08779 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT16P08779 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT16P08779 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT16P08779 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT16P08779 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT16P08779 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT16P08779 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT16P08779 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT16P08779 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT16P08779 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT16P08779 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT16P08779 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT16P08779 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT16P08779 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT16P08779 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT16P08779 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT16P08779 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT16P08779 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT16P08779 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT16P08779 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT16P08779 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT16P08779 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT16P08779 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT16P08779 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT16P08779 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT16P08779 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT16P08779 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT16P08779 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT16P08779 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT16P08779 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT16P08779 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT16P08779 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT16P08779 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT16P08779 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT16P08779 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT16P08779 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT16P08779 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT16P08779 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT16P08779 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT16P08779 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT16P08779 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT16P08779 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT16P08779 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT16P08779 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT16P08779 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT16P08779 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT16P08779 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT16P08779 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT16P08779 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT16P08779 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms