Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRCP08575 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRCP08575 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRCP08575 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRCP08575 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRCP08575 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
PTPRCP08575 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRCP08575 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PTPRCP08575 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRCP08575 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRCP08575 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRCP08575 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRCP08575 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRCP08575 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRCP08575 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRCP08575 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRCP08575 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRCP08575 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRCP08575 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRCP08575 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRCP08575 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRCP08575 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRCP08575 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRCP08575 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRCP08575 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRCP08575 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRCP08575 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRCP08575 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRCP08575 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRCP08575 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRCP08575 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRCP08575 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRCP08575 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
PTPRCP08575 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRCP08575 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRCP08575 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRCP08575 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRCP08575 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRCP08575 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRCP08575 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRCP08575 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRCP08575 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRCP08575 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRCP08575 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRCP08575 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRCP08575 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRCP08575 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRCP08575 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRCP08575 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
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