Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PFKMP08237 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PFKMP08237 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PFKMP08237 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PFKMP08237 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PFKMP08237 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PFKMP08237 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PFKMP08237 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PFKMP08237 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PFKMP08237 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PFKMP08237 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PFKMP08237 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PFKMP08237 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PFKMP08237 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PFKMP08237 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PFKMP08237 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PFKMP08237 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PFKMP08237 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PFKMP08237 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PFKMP08237 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PFKMP08237 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PFKMP08237 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PFKMP08237 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PFKMP08237 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PFKMP08237 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PFKMP08237 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PFKMP08237 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PFKMP08237 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PFKMP08237 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PFKMP08237 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PFKMP08237 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PFKMP08237 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PFKMP08237 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PFKMP08237 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PFKMP08237 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PFKMP08237 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PFKMP08237 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PFKMP08237 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PFKMP08237 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PFKMP08237 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PFKMP08237 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PFKMP08237 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PFKMP08237 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PFKMP08237 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PFKMP08237 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PFKMP08237 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PFKMP08237 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PFKMP08237 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PFKMP08237 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PFKMP08237 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PFKMP08237 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PFKMP08237 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PFKMP08237 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PFKMP08237 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PFKMP08237 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PFKMP08237 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PFKMP08237 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PFKMP08237 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PFKMP08237 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PFKMP08237 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PFKMP08237 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PFKMP08237 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PFKMP08237 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PFKMP08237 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PFKMP08237 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PFKMP08237 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PFKMP08237 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PFKMP08237 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PFKMP08237 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PFKMP08237 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PFKMP08237 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PFKMP08237 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PFKMP08237 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PFKMP08237 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PFKMP08237 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PFKMP08237 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PFKMP08237 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PFKMP08237 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PFKMP08237 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PFKMP08237 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PFKMP08237 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PFKMP08237 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PFKMP08237 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PFKMP08237 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PFKMP08237 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PFKMP08237 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PFKMP08237 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PFKMP08237 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PFKMP08237 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PFKMP08237 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PFKMP08237 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PFKMP08237 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PFKMP08237 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PFKMP08237 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PFKMP08237 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PFKMP08237 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PFKMP08237 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PFKMP08237 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PFKMP08237 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PFKMP08237 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms