Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB2P05107 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB2P05107 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB2P05107 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB2P05107 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB2P05107 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB2P05107 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB2P05107 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB2P05107 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB2P05107 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB2P05107 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGB2P05107 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB2P05107 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB2P05107 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB2P05107 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB2P05107 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB2P05107 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB2P05107 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB2P05107 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB2P05107 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB2P05107 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB2P05107 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB2P05107 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB2P05107 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB2P05107 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB2P05107 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB2P05107 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB2P05107 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGB2P05107 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB2P05107 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms