Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYCNP04198 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYCNP04198 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYCNP04198 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYCNP04198 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYCNP04198 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYCNP04198 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYCNP04198 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYCNP04198 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYCNP04198 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYCNP04198 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYCNP04198 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYCNP04198 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MYCNP04198 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYCNP04198 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYCNP04198 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYCNP04198 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYCNP04198 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYCNP04198 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYCNP04198 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYCNP04198 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYCNP04198 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYCNP04198 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYCNP04198 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYCNP04198 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYCNP04198 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYCNP04198 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYCNP04198 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYCNP04198 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYCNP04198 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYCNP04198 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MYCNP04198 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MYCNP04198 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYCNP04198 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
MYCNP04198 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYCNP04198 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYCNP04198 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYCNP04198 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYCNP04198 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYCNP04198 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYCNP04198 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYCNP04198 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYCNP04198 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYCNP04198 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYCNP04198 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYCNP04198 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYCNP04198 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
MYCNP04198 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYCNP04198 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYCNP04198 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MYCNP04198 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYCNP04198 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYCNP04198 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYCNP04198 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYCNP04198 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYCNP04198 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYCNP04198 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYCNP04198 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYCNP04198 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYCNP04198 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYCNP04198 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYCNP04198 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYCNP04198 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYCNP04198 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYCNP04198 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYCNP04198 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYCNP04198 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYCNP04198 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYCNP04198 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYCNP04198 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MYCNP04198 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYCNP04198 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYCNP04198 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYCNP04198 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYCNP04198 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYCNP04198 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYCNP04198 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MYCNP04198 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
MYCNP04198 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYCNP04198 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYCNP04198 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYCNP04198 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MYCNP04198 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYCNP04198 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYCNP04198 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYCNP04198 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYCNP04198 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYCNP04198 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MYCNP04198 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MYCNP04198 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MYCNP04198 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MYCNP04198 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYCNP04198 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYCNP04198 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYCNP04198 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYCNP04198 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYCNP04198 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYCNP04198 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MYCNP04198 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYCNP04198 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms