Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEBLO76041 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEBLO76041 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEBLO76041 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEBLO76041 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEBLO76041 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEBLO76041 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEBLO76041 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEBLO76041 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEBLO76041 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEBLO76041 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEBLO76041 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEBLO76041 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEBLO76041 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEBLO76041 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEBLO76041 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEBLO76041 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEBLO76041 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEBLO76041 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEBLO76041 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEBLO76041 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEBLO76041 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEBLO76041 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEBLO76041 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEBLO76041 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEBLO76041 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEBLO76041 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NEBLO76041 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NEBLO76041 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEBLO76041 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEBLO76041 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEBLO76041 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEBLO76041 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEBLO76041 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEBLO76041 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEBLO76041 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEBLO76041 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEBLO76041 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEBLO76041 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEBLO76041 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEBLO76041 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEBLO76041 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEBLO76041 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEBLO76041 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEBLO76041 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEBLO76041 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEBLO76041 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEBLO76041 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEBLO76041 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEBLO76041 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEBLO76041 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEBLO76041 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEBLO76041 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NEBLO76041 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NEBLO76041 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEBLO76041 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEBLO76041 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEBLO76041 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NEBLO76041 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEBLO76041 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEBLO76041 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEBLO76041 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEBLO76041 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEBLO76041 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEBLO76041 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEBLO76041 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEBLO76041 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEBLO76041 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEBLO76041 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEBLO76041 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEBLO76041 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEBLO76041 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEBLO76041 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEBLO76041 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEBLO76041 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEBLO76041 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEBLO76041 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEBLO76041 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEBLO76041 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEBLO76041 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEBLO76041 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEBLO76041 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEBLO76041 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEBLO76041 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEBLO76041 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEBLO76041 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEBLO76041 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEBLO76041 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEBLO76041 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEBLO76041 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEBLO76041 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEBLO76041 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEBLO76041 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEBLO76041 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEBLO76041 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEBLO76041 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEBLO76041 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEBLO76041 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEBLO76041 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEBLO76041 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms