Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPXO76031 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPXO76031 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPXO76031 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPXO76031 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPXO76031 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPXO76031 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPXO76031 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPXO76031 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPXO76031 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPXO76031 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPXO76031 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPXO76031 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLPXO76031 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLPXO76031 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPXO76031 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPXO76031 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPXO76031 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPXO76031 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPXO76031 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPXO76031 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPXO76031 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPXO76031 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPXO76031 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPXO76031 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPXO76031 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPXO76031 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPXO76031 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLPXO76031 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPXO76031 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPXO76031 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPXO76031 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPXO76031 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPXO76031 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPXO76031 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLPXO76031 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPXO76031 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPXO76031 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPXO76031 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPXO76031 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPXO76031 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPXO76031 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPXO76031 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPXO76031 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPXO76031 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPXO76031 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPXO76031 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPXO76031 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPXO76031 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPXO76031 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPXO76031 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPXO76031 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPXO76031 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPXO76031 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPXO76031 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPXO76031 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPXO76031 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPXO76031 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPXO76031 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPXO76031 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPXO76031 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPXO76031 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLPXO76031 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLPXO76031 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLPXO76031 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLPXO76031 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLPXO76031 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLPXO76031 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLPXO76031 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLPXO76031 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPXO76031 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPXO76031 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPXO76031 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPXO76031 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPXO76031 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPXO76031 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPXO76031 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLPXO76031 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLPXO76031 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLPXO76031 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPXO76031 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPXO76031 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPXO76031 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPXO76031 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPXO76031 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPXO76031 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPXO76031 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPXO76031 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPXO76031 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPXO76031 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPXO76031 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPXO76031 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPXO76031 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPXO76031 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPXO76031 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPXO76031 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPXO76031 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPXO76031 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLPXO76031 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLPXO76031 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms