Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIOO75962 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIOO75962 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIOO75962 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIOO75962 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIOO75962 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIOO75962 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIOO75962 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIOO75962 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIOO75962 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIOO75962 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIOO75962 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIOO75962 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIOO75962 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIOO75962 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIOO75962 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIOO75962 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIOO75962 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIOO75962 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIOO75962 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIOO75962 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIOO75962 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIOO75962 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIOO75962 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIOO75962 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIOO75962 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIOO75962 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIOO75962 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIOO75962 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIOO75962 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIOO75962 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIOO75962 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIOO75962 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIOO75962 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIOO75962 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIOO75962 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIOO75962 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIOO75962 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIOO75962 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIOO75962 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIOO75962 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIOO75962 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIOO75962 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIOO75962 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIOO75962 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIOO75962 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIOO75962 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIOO75962 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIOO75962 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIOO75962 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIOO75962 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIOO75962 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIOO75962 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIOO75962 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIOO75962 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIOO75962 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIOO75962 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIOO75962 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIOO75962 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIOO75962 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIOO75962 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIOO75962 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIOO75962 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIOO75962 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIOO75962 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIOO75962 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIOO75962 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIOO75962 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIOO75962 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIOO75962 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIOO75962 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIOO75962 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIOO75962 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIOO75962 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIOO75962 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIOO75962 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIOO75962 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIOO75962 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIOO75962 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIOO75962 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIOO75962 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIOO75962 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIOO75962 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIOO75962 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIOO75962 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIOO75962 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIOO75962 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIOO75962 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIOO75962 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIOO75962 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIOO75962 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIOO75962 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIOO75962 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIOO75962 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIOO75962 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIOO75962 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIOO75962 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIOO75962 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIOO75962 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIOO75962 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms