Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSO75390 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSO75390 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CSO75390 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSO75390 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSO75390 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSO75390 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSO75390 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSO75390 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSO75390 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSO75390 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSO75390 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSO75390 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSO75390 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSO75390 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSO75390 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSO75390 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSO75390 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSO75390 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSO75390 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSO75390 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSO75390 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSO75390 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSO75390 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSO75390 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSO75390 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSO75390 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSO75390 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSO75390 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSO75390 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSO75390 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSO75390 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSO75390 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSO75390 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSO75390 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSO75390 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSO75390 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSO75390 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSO75390 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSO75390 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSO75390 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSO75390 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSO75390 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSO75390 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSO75390 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSO75390 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CSO75390 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSO75390 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSO75390 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSO75390 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSO75390 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSO75390 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSO75390 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSO75390 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSO75390 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSO75390 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSO75390 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSO75390 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSO75390 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSO75390 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSO75390 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSO75390 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSO75390 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSO75390 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSO75390 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSO75390 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSO75390 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSO75390 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSO75390 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSO75390 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSO75390 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSO75390 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSO75390 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CSO75390 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSO75390 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSO75390 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSO75390 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSO75390 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSO75390 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CSO75390 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSO75390 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CSO75390 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSO75390 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSO75390 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSO75390 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSO75390 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSO75390 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSO75390 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSO75390 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSO75390 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSO75390 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSO75390 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CSO75390 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSO75390 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSO75390 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSO75390 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSO75390 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSO75390 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSO75390 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSO75390 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms