Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF40O75150 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF40O75150 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF40O75150 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF40O75150 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF40O75150 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF40O75150 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF40O75150 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF40O75150 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF40O75150 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF40O75150 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF40O75150 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF40O75150 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF40O75150 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF40O75150 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF40O75150 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF40O75150 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF40O75150 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF40O75150 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF40O75150 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF40O75150 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF40O75150 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF40O75150 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF40O75150 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF40O75150 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF40O75150 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF40O75150 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF40O75150 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF40O75150 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF40O75150 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF40O75150 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF40O75150 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF40O75150 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF40O75150 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF40O75150 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF40O75150 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF40O75150 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF40O75150 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF40O75150 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF40O75150 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF40O75150 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF40O75150 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF40O75150 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF40O75150 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF40O75150 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF40O75150 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF40O75150 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF40O75150 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF40O75150 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF40O75150 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF40O75150 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF40O75150 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF40O75150 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF40O75150 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF40O75150 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF40O75150 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF40O75150 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF40O75150 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF40O75150 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF40O75150 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF40O75150 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF40O75150 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF40O75150 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF40O75150 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF40O75150 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF40O75150 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF40O75150 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF40O75150 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF40O75150 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF40O75150 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF40O75150 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF40O75150 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF40O75150 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF40O75150 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF40O75150 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF40O75150 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF40O75150 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF40O75150 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF40O75150 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF40O75150 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF40O75150 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF40O75150 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF40O75150 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF40O75150 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF40O75150 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF40O75150 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF40O75150 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF40O75150 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF40O75150 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF40O75150 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF40O75150 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF40O75150 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF40O75150 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF40O75150 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF40O75150 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF40O75150 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF40O75150 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF40O75150 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF40O75150 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF40O75150 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms