Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF1CO43896 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF1CO43896 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF1CO43896 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF1CO43896 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF1CO43896 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms