Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLX3O43711 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLX3O43711 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLX3O43711 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLX3O43711 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLX3O43711 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLX3O43711 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLX3O43711 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLX3O43711 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLX3O43711 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLX3O43711 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLX3O43711 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLX3O43711 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLX3O43711 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TLX3O43711 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLX3O43711 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLX3O43711 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLX3O43711 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLX3O43711 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLX3O43711 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLX3O43711 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLX3O43711 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLX3O43711 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLX3O43711 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLX3O43711 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLX3O43711 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLX3O43711 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLX3O43711 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLX3O43711 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLX3O43711 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLX3O43711 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLX3O43711 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLX3O43711 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLX3O43711 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLX3O43711 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLX3O43711 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TLX3O43711 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TLX3O43711 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLX3O43711 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLX3O43711 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLX3O43711 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLX3O43711 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLX3O43711 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLX3O43711 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLX3O43711 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLX3O43711 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLX3O43711 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLX3O43711 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLX3O43711 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TLX3O43711 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLX3O43711 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLX3O43711 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLX3O43711 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLX3O43711 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLX3O43711 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLX3O43711 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLX3O43711 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLX3O43711 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLX3O43711 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLX3O43711 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLX3O43711 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLX3O43711 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLX3O43711 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLX3O43711 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLX3O43711 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLX3O43711 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLX3O43711 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TLX3O43711 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLX3O43711 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLX3O43711 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLX3O43711 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLX3O43711 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLX3O43711 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLX3O43711 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLX3O43711 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLX3O43711 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TLX3O43711 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLX3O43711 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLX3O43711 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLX3O43711 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLX3O43711 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLX3O43711 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLX3O43711 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLX3O43711 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLX3O43711 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLX3O43711 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLX3O43711 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLX3O43711 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLX3O43711 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLX3O43711 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLX3O43711 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLX3O43711 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLX3O43711 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TLX3O43711 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLX3O43711 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLX3O43711 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLX3O43711 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLX3O43711 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLX3O43711 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLX3O43711 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms