Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRY3O43610 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRY3O43610 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRY3O43610 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRY3O43610 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms