Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP8O43159 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP8O43159 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP8O43159 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP8O43159 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP8O43159 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP8O43159 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP8O43159 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP8O43159 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP8O43159 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP8O43159 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP8O43159 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP8O43159 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP8O43159 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP8O43159 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP8O43159 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP8O43159 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP8O43159 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP8O43159 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP8O43159 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP8O43159 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP8O43159 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP8O43159 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP8O43159 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP8O43159 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP8O43159 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP8O43159 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP8O43159 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP8O43159 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP8O43159 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP8O43159 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP8O43159 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP8O43159 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP8O43159 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP8O43159 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP8O43159 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP8O43159 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP8O43159 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP8O43159 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP8O43159 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP8O43159 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP8O43159 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP8O43159 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP8O43159 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP8O43159 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP8O43159 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP8O43159 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP8O43159 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP8O43159 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP8O43159 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP8O43159 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP8O43159 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP8O43159 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP8O43159 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP8O43159 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP8O43159 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP8O43159 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP8O43159 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP8O43159 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP8O43159 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP8O43159 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP8O43159 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP8O43159 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP8O43159 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP8O43159 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP8O43159 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP8O43159 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP8O43159 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP8O43159 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP8O43159 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP8O43159 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP8O43159 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP8O43159 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP8O43159 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP8O43159 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP8O43159 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP8O43159 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP8O43159 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP8O43159 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP8O43159 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP8O43159 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP8O43159 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP8O43159 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP8O43159 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP8O43159 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP8O43159 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP8O43159 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP8O43159 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP8O43159 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP8O43159 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP8O43159 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP8O43159 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP8O43159 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP8O43159 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP8O43159 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP8O43159 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP8O43159 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP8O43159 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP8O43159 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP8O43159 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms