Protein–RNA interactions for Protein: O43149

ZZEF1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZZEF1O43149 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZZEF1O43149 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZZEF1O43149 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZZEF1O43149 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZZEF1O43149 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZZEF1O43149 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZZEF1O43149 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZZEF1O43149 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZZEF1O43149 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZZEF1O43149 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZZEF1O43149 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZZEF1O43149 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZZEF1O43149 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZZEF1O43149 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZZEF1O43149 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZZEF1O43149 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZZEF1O43149 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZZEF1O43149 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZZEF1O43149 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZZEF1O43149 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZZEF1O43149 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZZEF1O43149 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZZEF1O43149 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZZEF1O43149 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZZEF1O43149 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZZEF1O43149 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZZEF1O43149 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZZEF1O43149 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZZEF1O43149 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZZEF1O43149 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZZEF1O43149 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZZEF1O43149 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZZEF1O43149 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZZEF1O43149 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZZEF1O43149 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZZEF1O43149 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZZEF1O43149 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZZEF1O43149 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZZEF1O43149 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZZEF1O43149 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZZEF1O43149 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZZEF1O43149 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZZEF1O43149 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZZEF1O43149 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZZEF1O43149 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZZEF1O43149 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZZEF1O43149 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZZEF1O43149 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZZEF1O43149 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZZEF1O43149 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZZEF1O43149 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZZEF1O43149 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZZEF1O43149 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZZEF1O43149 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZZEF1O43149 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZZEF1O43149 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZZEF1O43149 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZZEF1O43149 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZZEF1O43149 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZZEF1O43149 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms