Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GRIN2DO15399 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2DO15399 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2DO15399 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2DO15399 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2DO15399 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2DO15399 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2DO15399 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2DO15399 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2DO15399 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2DO15399 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2DO15399 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2DO15399 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2DO15399 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2DO15399 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2DO15399 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2DO15399 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2DO15399 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2DO15399 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2DO15399 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2DO15399 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms