Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PTPRTO14522 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PTPRTO14522 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PTPRTO14522 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PTPRTO14522 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PTPRTO14522 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRTO14522 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRTO14522 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PTPRTO14522 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PTPRTO14522 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PTPRTO14522 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PTPRTO14522 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PTPRTO14522 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PTPRTO14522 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PTPRTO14522 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PTPRTO14522 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PTPRTO14522 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PTPRTO14522 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
PTPRTO14522 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PTPRTO14522 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PTPRTO14522 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
PTPRTO14522 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PTPRTO14522 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRTO14522 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRTO14522 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRTO14522 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRTO14522 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PTPRTO14522 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
PTPRTO14522 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PTPRTO14522 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PTPRTO14522 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PTPRTO14522 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
PTPRTO14522 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PTPRTO14522 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PTPRTO14522 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PTPRTO14522 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PTPRTO14522 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PTPRTO14522 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PTPRTO14522 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PTPRTO14522 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PTPRTO14522 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PTPRTO14522 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PTPRTO14522 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PTPRTO14522 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PTPRTO14522 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PTPRTO14522 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRTO14522 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRTO14522 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRTO14522 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRTO14522 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PTPRTO14522 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PTPRTO14522 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PTPRTO14522 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PTPRTO14522 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PTPRTO14522 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PTPRTO14522 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PTPRTO14522 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PTPRTO14522 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
PTPRTO14522 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PTPRTO14522 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PTPRTO14522 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PTPRTO14522 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PTPRTO14522 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PTPRTO14522 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PTPRTO14522 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
PTPRTO14522 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PTPRTO14522 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PTPRTO14522 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PTPRTO14522 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PTPRTO14522 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PTPRTO14522 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PTPRTO14522 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PTPRTO14522 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
PTPRTO14522 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
PTPRTO14522 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PTPRTO14522 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
PTPRTO14522 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PTPRTO14522 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PTPRTO14522 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
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