Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFRD1O00458 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFRD1O00458 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFRD1O00458 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFRD1O00458 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFRD1O00458 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFRD1O00458 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFRD1O00458 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFRD1O00458 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFRD1O00458 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFRD1O00458 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IFRD1O00458 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFRD1O00458 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFRD1O00458 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFRD1O00458 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFRD1O00458 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFRD1O00458 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IFRD1O00458 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFRD1O00458 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFRD1O00458 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFRD1O00458 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFRD1O00458 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFRD1O00458 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFRD1O00458 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFRD1O00458 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFRD1O00458 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms