Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFXAPO00287 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFXAPO00287 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFXAPO00287 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFXAPO00287 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFXAPO00287 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFXAPO00287 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFXAPO00287 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFXAPO00287 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFXAPO00287 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFXAPO00287 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFXAPO00287 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RFXAPO00287 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFXAPO00287 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFXAPO00287 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFXAPO00287 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RFXAPO00287 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RFXAPO00287 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFXAPO00287 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFXAPO00287 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFXAPO00287 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFXAPO00287 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFXAPO00287 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFXAPO00287 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFXAPO00287 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RFXAPO00287 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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