Protein–RNA interactions for Protein: H3BQZ7

HNRNPUL2-BSCL2, HCG2044799, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC41.55■■■■■ 4.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.36■■■■■ 4.21
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC41.25■■■■■ 4.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC41.23■■■■■ 4.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC41.18■■■■■ 4.18
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms