Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C4orf47A7E2U8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4orf47A7E2U8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4orf47A7E2U8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4orf47A7E2U8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C4orf47A7E2U8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C4orf47A7E2U8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C4orf47A7E2U8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C4orf47A7E2U8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C4orf47A7E2U8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C4orf47A7E2U8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C4orf47A7E2U8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4orf47A7E2U8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4orf47A7E2U8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4orf47A7E2U8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4orf47A7E2U8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4orf47A7E2U8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4orf47A7E2U8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4orf47A7E2U8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4orf47A7E2U8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
C4orf47A7E2U8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C4orf47A7E2U8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C4orf47A7E2U8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C4orf47A7E2U8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C4orf47A7E2U8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4orf47A7E2U8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4orf47A7E2U8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C4orf47A7E2U8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C4orf47A7E2U8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C4orf47A7E2U8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C4orf47A7E2U8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C4orf47A7E2U8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4orf47A7E2U8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C4orf47A7E2U8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C4orf47A7E2U8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
C4orf47A7E2U8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C4orf47A7E2U8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C4orf47A7E2U8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms