Protein–RNA interactions for Protein: A1A4G5

LNP1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1A1A4G5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LNP1A1A4G5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNP1A1A4G5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNP1A1A4G5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LNP1A1A4G5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LNP1A1A4G5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LNP1A1A4G5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LNP1A1A4G5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LNP1A1A4G5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LNP1A1A4G5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LNP1A1A4G5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LNP1A1A4G5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LNP1A1A4G5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LNP1A1A4G5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LNP1A1A4G5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LNP1A1A4G5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LNP1A1A4G5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LNP1A1A4G5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LNP1A1A4G5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LNP1A1A4G5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LNP1A1A4G5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LNP1A1A4G5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LNP1A1A4G5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LNP1A1A4G5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNP1A1A4G5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms