Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM9

MEIKIN, Meiosis-specific kinetochore protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIKINA0A087WXM9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIKINA0A087WXM9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIKINA0A087WXM9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIKINA0A087WXM9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIKINA0A087WXM9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIKINA0A087WXM9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIKINA0A087WXM9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIKINA0A087WXM9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIKINA0A087WXM9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIKINA0A087WXM9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIKINA0A087WXM9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIKINA0A087WXM9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIKINA0A087WXM9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIKINA0A087WXM9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIKINA0A087WXM9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIKINA0A087WXM9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIKINA0A087WXM9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIKINA0A087WXM9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIKINA0A087WXM9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms