Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.75■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC62.75■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.73■■■■■ 7.63
NISCHQ9Y2I1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC62.7■■■■■ 7.63
NISCHQ9Y2I1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC62.7■■■■■ 7.63
NISCHQ9Y2I1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.67■■■■■ 7.62
NISCHQ9Y2I1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC62.66■■■■■ 7.62
NISCHQ9Y2I1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC62.65■■■■■ 7.62
NISCHQ9Y2I1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC62.65■■■■■ 7.62
NISCHQ9Y2I1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC62.65■■■■■ 7.62
NISCHQ9Y2I1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC62.64■■■■■ 7.62
NISCHQ9Y2I1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC62.64■■■■■ 7.62
NISCHQ9Y2I1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC62.64■■■■■ 7.62
NISCHQ9Y2I1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC62.63■■■■■ 7.62
NISCHQ9Y2I1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.62■■■■■ 7.62
NISCHQ9Y2I1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC62.62■■■■■ 7.61
NISCHQ9Y2I1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC62.61■■■■■ 7.61
NISCHQ9Y2I1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.6■■■■■ 7.61
NISCHQ9Y2I1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC62.58■■■■■ 7.61
NISCHQ9Y2I1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.53■■■■■ 7.6
NISCHQ9Y2I1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC62.53■■■■■ 7.6
NISCHQ9Y2I1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC62.52■■■■■ 7.6
NISCHQ9Y2I1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC62.52■■■■■ 7.6
NISCHQ9Y2I1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.51■■■■■ 7.6
NISCHQ9Y2I1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.5■■■■■ 7.6
NISCHQ9Y2I1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC62.5■■■■■ 7.6
NISCHQ9Y2I1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC62.5■■■■■ 7.6
NISCHQ9Y2I1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC62.5■■■■■ 7.6
NISCHQ9Y2I1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC62.49■■■■■ 7.59
NISCHQ9Y2I1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC62.47■■■■■ 7.59
NISCHQ9Y2I1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC62.47■■■■■ 7.59
NISCHQ9Y2I1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC62.46■■■■■ 7.59
NISCHQ9Y2I1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.46■■■■■ 7.59
NISCHQ9Y2I1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC62.45■■■■■ 7.59
NISCHQ9Y2I1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC62.45■■■■■ 7.59
NISCHQ9Y2I1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC62.45■■■■■ 7.59
NISCHQ9Y2I1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC62.44■■■■■ 7.59
NISCHQ9Y2I1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC62.43■■■■■ 7.58
NISCHQ9Y2I1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.42■■■■■ 7.58
NISCHQ9Y2I1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC62.41■■■■■ 7.58
NISCHQ9Y2I1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC62.41■■■■■ 7.58
NISCHQ9Y2I1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC62.4■■■■■ 7.58
NISCHQ9Y2I1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC62.39■■■■■ 7.58
NISCHQ9Y2I1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC62.38■■■■■ 7.58
NISCHQ9Y2I1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC62.37■■■■■ 7.58
NISCHQ9Y2I1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC62.37■■■■■ 7.58
NISCHQ9Y2I1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.32■■■■■ 7.57
NISCHQ9Y2I1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC62.31■■■■■ 7.57
NISCHQ9Y2I1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC62.31■■■■■ 7.57
NISCHQ9Y2I1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC62.31■■■■■ 7.56
NISCHQ9Y2I1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC62.29■■■■■ 7.56
NISCHQ9Y2I1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC62.27■■■■■ 7.56
NISCHQ9Y2I1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC62.27■■■■■ 7.56
NISCHQ9Y2I1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC62.25■■■■■ 7.56
NISCHQ9Y2I1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC62.23■■■■■ 7.55
NISCHQ9Y2I1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC62.2■■■■■ 7.55
NISCHQ9Y2I1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC62.2■■■■■ 7.55
NISCHQ9Y2I1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.19■■■■■ 7.55
NISCHQ9Y2I1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC62.19■■■■■ 7.55
NISCHQ9Y2I1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC62.18■■■■■ 7.54
NISCHQ9Y2I1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC62.17■■■■■ 7.54
NISCHQ9Y2I1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC62.17■■■■■ 7.54
NISCHQ9Y2I1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC62.17■■■■■ 7.54
NISCHQ9Y2I1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC62.17■■■■■ 7.54
NISCHQ9Y2I1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC62.17■■■■■ 7.54
NISCHQ9Y2I1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC62.17■■■■■ 7.54
NISCHQ9Y2I1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC62.17■■■■■ 7.54
NISCHQ9Y2I1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC62.17■■■■■ 7.54
NISCHQ9Y2I1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.12■■■■■ 7.54
NISCHQ9Y2I1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC62.12■■■■■ 7.54
NISCHQ9Y2I1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC62.12■■■■■ 7.54
NISCHQ9Y2I1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC62.12■■■■■ 7.53
NISCHQ9Y2I1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC62.08■■■■■ 7.53
NISCHQ9Y2I1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC62.08■■■■■ 7.53
NISCHQ9Y2I1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC62.08■■■■■ 7.53
NISCHQ9Y2I1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.07■■■■■ 7.53
NISCHQ9Y2I1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.07■■■■■ 7.53
NISCHQ9Y2I1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC62.07■■■■■ 7.53
NISCHQ9Y2I1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.06■■■■■ 7.53
NISCHQ9Y2I1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC62.02■■■■■ 7.52
NISCHQ9Y2I1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC62■■■■■ 7.52
NISCHQ9Y2I1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC62■■■■■ 7.52
NISCHQ9Y2I1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC61.98■■■■■ 7.51
NISCHQ9Y2I1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC61.98■■■■■ 7.51
NISCHQ9Y2I1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC61.97■■■■■ 7.51
NISCHQ9Y2I1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC61.97■■■■■ 7.51
NISCHQ9Y2I1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC61.97■■■■■ 7.51
NISCHQ9Y2I1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC61.95■■■■■ 7.51
NISCHQ9Y2I1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC61.94■■■■■ 7.51
NISCHQ9Y2I1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC61.94■■■■■ 7.51
NISCHQ9Y2I1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC61.94■■■■■ 7.51
NISCHQ9Y2I1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.93■■■■■ 7.5
NISCHQ9Y2I1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC61.92■■■■■ 7.5
NISCHQ9Y2I1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.92■■■■■ 7.5
NISCHQ9Y2I1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC61.91■■■■■ 7.5
NISCHQ9Y2I1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.91■■■■■ 7.5
NISCHQ9Y2I1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC61.9■■■■■ 7.5
NISCHQ9Y2I1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC61.89■■■■■ 7.5
NISCHQ9Y2I1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC61.88■■■■■ 7.5
NISCHQ9Y2I1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC61.88■■■■■ 7.5
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