Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNNQ9UQP3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNNQ9UQP3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNNQ9UQP3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNNQ9UQP3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNNQ9UQP3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNNQ9UQP3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNNQ9UQP3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNNQ9UQP3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNNQ9UQP3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNNQ9UQP3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNNQ9UQP3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TNNQ9UQP3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNNQ9UQP3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNNQ9UQP3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNNQ9UQP3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNNQ9UQP3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TNNQ9UQP3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TNNQ9UQP3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
TNNQ9UQP3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNNQ9UQP3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNNQ9UQP3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNNQ9UQP3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNNQ9UQP3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNNQ9UQP3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNNQ9UQP3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNNQ9UQP3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNNQ9UQP3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNNQ9UQP3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNNQ9UQP3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNNQ9UQP3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNNQ9UQP3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNNQ9UQP3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNNQ9UQP3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNNQ9UQP3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TNNQ9UQP3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNNQ9UQP3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TNNQ9UQP3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNNQ9UQP3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNNQ9UQP3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNNQ9UQP3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNNQ9UQP3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNNQ9UQP3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNNQ9UQP3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNNQ9UQP3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TNNQ9UQP3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TNNQ9UQP3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TNNQ9UQP3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNNQ9UQP3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNNQ9UQP3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNNQ9UQP3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNNQ9UQP3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TNNQ9UQP3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TNNQ9UQP3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TNNQ9UQP3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TNNQ9UQP3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms