Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACSL6Q9UKU0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACSL6Q9UKU0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACSL6Q9UKU0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSL6Q9UKU0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACSL6Q9UKU0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ACSL6Q9UKU0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACSL6Q9UKU0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSL6Q9UKU0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSL6Q9UKU0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSL6Q9UKU0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ACSL6Q9UKU0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSL6Q9UKU0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSL6Q9UKU0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSL6Q9UKU0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSL6Q9UKU0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSL6Q9UKU0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSL6Q9UKU0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSL6Q9UKU0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSL6Q9UKU0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSL6Q9UKU0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSL6Q9UKU0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSL6Q9UKU0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSL6Q9UKU0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSL6Q9UKU0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSL6Q9UKU0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSL6Q9UKU0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ACSL6Q9UKU0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSL6Q9UKU0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSL6Q9UKU0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms