Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF223Q9UK11 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF223Q9UK11 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF223Q9UK11 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF223Q9UK11 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF223Q9UK11 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF223Q9UK11 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF223Q9UK11 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF223Q9UK11 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF223Q9UK11 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF223Q9UK11 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF223Q9UK11 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF223Q9UK11 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF223Q9UK11 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF223Q9UK11 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF223Q9UK11 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF223Q9UK11 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF223Q9UK11 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF223Q9UK11 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF223Q9UK11 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms