Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN2Q9UHV9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN2Q9UHV9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PFDN2Q9UHV9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PFDN2Q9UHV9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms