Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMPXQ9UHP9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMPXQ9UHP9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPXQ9UHP9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMPXQ9UHP9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMPXQ9UHP9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMPXQ9UHP9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMPXQ9UHP9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPXQ9UHP9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPXQ9UHP9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPXQ9UHP9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPXQ9UHP9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPXQ9UHP9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPXQ9UHP9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPXQ9UHP9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPXQ9UHP9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPXQ9UHP9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPXQ9UHP9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMPXQ9UHP9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms